Phylogenetic Analysis of Avian Poxviruses among Free-Ranging Birds of Virginia

Publication Type:Journal Article
Year of Publication:2005
Authors:Adams, CJ, Feldman, SH, Sleeman, JM
Journal:Avian Diseases
Volume:49
Issue:4
Date Published:2005
ISBN Number:00052086
Keywords:Accipitridae, Ardea, Ardea herodias, Ardeidae, Burrica mexicana, Buteo, Buteo jamaicensis, Cardinalidae, Cardinalis, Cardinalis cardinalis, Carpodacus, Carpodacus mexicanus, Columbidae, Corvidae, Corvus, Corvus brachyrhynchos, Corvus corone, Egretta, Egretta sacra, Erithacus, Erithacus rubecula, Europe, Fringillidae, Haemorhous, Haemorhous mexicanus, Herodias, Mimidae, Mimus, Mimus polyglottos, Muscicapidae, Polioptila, Polioptila caerulea, Polioptilidae, Turdidae, Turdus, Turdus migratorius, Zenaida, Zenaida macroura, Zenaidura macroura
Abstract:Polymerase chain reaction was used to amplify a portion of the avian poxvirus core 4b gene of infected free-ranging birds that presented at the Wildlife Center of Virginia during the 2003 and early 2004 years. The species of bird infected were a great blue heron (Ardea herodias), two American crows (Corvus brachyrhyncos), two American robins (Turdus migratorius), two mourning doves (Zenaida macroura), a red-tailed hawk (Buteo jamaicensis), a blue-gray gnatcatcher (Polioptila caerulea), a northern mockingbird (Mimus polyglottos), a house finch (Carpodacus mexicanus), and a northern cardinal (Cardinalis cardinalis). Phylogenetic analysis was performed using the consensus sequences determined for each avian case in Virginia in combination with avian poxvirus core 4b gene sequence from isolates previously described in Europe and that of vaccinia virus. Alignment of DNA sequences identified areas of point mutations and, in the case of a single mourning dove, the incorporation of a triplet of nucleotides. Maximum-likelihood analysis grouped the 2003-2004 Virginia avian poxviruses into a clade distinct from those reported in European free-ranging birds, with the exception of a single case in a mourning dove that clustered within one European clade. The cladogram that resulted from our analysis of the European isolates is in agreement with those previously published. This study identified a distinct clade of avian poxvirus unique from four clades previously described and associated with epornitics in free-ranging birds, where the core 4b gene DNA sequence has been the basis of comparison. /// Se empleó la prueba de la reacción en cadena por la polimerasa para amplificar una porción del gen 4b del virus de la viruela aviar de aves silvestres infectadas que fueron remitidas a un laboratorio del estado de Virginia durante el año 2003 y principios del año 2004. Las especies de aves infectadas fueron: una garza morena (Ardea herodias), dos cuervos Americanos (Corvus brachyrhyncos), dos mirlos primavera (Turdus migratorius), dos palomas huilotas (Zenaida macroura), una aguililla de cola roja (Buteo jamaicensis), una perlita azulgris (Polioptila caerulea), un cenzontle norteño (Mimus polyglottos), un pinzón mexicano (Carpodacus mexicanus) y un cardenal rojo (Cardinalis cardinalis). El análisis filogenético se llevó a cabo comparando el consenso de las secuencias del gen 4b del virus de viruela aviar obtenidas a partir de cada caso en el estado de Virginia, con secuencias de aislamientos previamente descritos en Europa y del virus de viruela. Se identificaron áreas de mutaciones de punto mediante la alineación de las secuencias y en el caso de una paloma huilota la incorporación de tres nucleótidos. Mediante el análisis de la máxima probabilidad, los aislamientos de viruela aviar del estado de Virginia aislados durante los años 2003 y 2004 se ubicaron en un grupo diferente al de los aislamientos obtenidos a partir de aves silvestres reportados en Europa, con la excepción de un aislamiento obtenido a partir de una paloma huilota, el cual se localizó dentro de un grupo Europeo. El árbol filogenético obtenido en nuestro análisis de aislamientos Europeos coincidió con árboles filogenéticos publicados anteriormente. En este estudio se identificó un grupo genotípico único de virus de viruela aviar diferente a los cuatro grupos genotípicos previamente descritos, asociados con brotes eporniticos en aves silvestres, en los cuales se ha empleado la secuencia del gen 4b como base para dicha comparación.
URL:http://www.jstor.org/stable/4099210
Short Title:Avian Diseases
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