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Birds of Indian Subcontinent

Molecular Characterization of Low Pathogenicity H7N3 Avian Influenza Viruses Isolated in Italy

Publication Type:Journal Article
Year of Publication:2004
Authors:Di Trani, L, Bedini, B, Cordioli, P, Muscillo, M, Vignolo, E, Moreno, A, Tollis, M
Journal:Avian Diseases
Volume:48
Issue:2
Date Published:2004
ISBN Number:00052086
Keywords:Italy, Meleagris, Meleagris gallopavo, Pavo, Phasianidae
Abstract:The complete coding regions of the surface glycoproteins, nucleoprotein (NP), polymerase 2 (PB2), and matrix (M) of A/turkey/214845/02 and A/turkey/220158/99 (H7N3) low pathogenicity avian influenza (LPAI) viruses isolated in October 2002 in Italy were amplified and sequenced to determine the epidemiologic relationships with an A/turkey/Italy/4603/99 (H7N1/4603/99) LPAI virus isolated during the 1999-2001 epizootic in Italy. The hemagglutinin (HA) of H7N3 viruses showed 97.8% nucleotide similarity with A/turkey/Italy/4603/99 (H7N1), and NP, M, and PB2 gene similarities were 93.6%, 98.2%, and 96.2%, respectively. Phylogenetic analyses of HA, PB2, and M genes showed that H7N3 and H7N1 viruses were closely related. Sequence analysis revealed a 23 amino acid deletion in the stalk of the neuraminidase of H7N3 viruses and a unique deletion of amino acid glycine in position 17 in the NP gene of H7N1 virus. /// Se amplificaron y secuenciaron por completo las regiones codificadoras de las glicoproteínas de superficie, nucleoproteína (NP), polimerasa 2 (PB2) y matriz (M) de los virus de influenza aviar de baja patogenicidad A/pavo/214845/02 y A/pavo/220158/99 pertenecientes al subtipo H7N3, los cuales fueron aislados en Octubre del 2002 en Italia. También se determinó su relación epidemiológica con el virus de baja patogenicidad A/pavo/Italia/4603/99 (H7N1/4603/99) que fue aislado durante la epizootia ocurrida entre 1999 y 2001 en Italia. La secuencia de nucleótidos del gen para la hemoaglutinina (HA) de los virus H7N3 mostró una similitud del 97.8% con la correspondiente al virus A/pavo/Italia/4603/99 (H7N1), mientras que los genes NP, M, y PB2 presentaron similitudes de 93.6%, 98.2% y 96.2, respectivamente. Los análisis filogenéticos de los genes HA, PB2 y M demostraron que los virus H7N3 y H7N1 están relacionados cercanamente. El análisis de las secuencias reveló una deleción en la neuraminidasa de los virus H7N3 y una deleción del aminoácido glicina en la posición 17 en el gen NP del virus H7N1.
URL:http://www.jstor.org/stable/1593287
Short Title:Avian Diseases
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