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Birds of Indian Subcontinent

Molecular Characteristics of Full-Length Genomic Segment A of Three Infectious Bursal Disease Viruses in China: Two Attenuated Strains and One Virulent Field Strain

Publication Type:Journal Article
Year of Publication:2001
Authors:Yu, L, Li, JR, Huang, YW, Dikki, J, Deng, R
Journal:Avian Diseases
Volume:45
Issue:4
Date Published:2001
ISBN Number:00052086
Keywords:China, Fringillidae, Serinus, Serinus serinus
Abstract:The full-length cDNA of genomic segment A of three infectious bursal disease viruses, two attenuated strains (HZ2 and JD1) and one virulent field strain (ZJ2000), was amplified in a single step by reverse transcription-polymerase chain reaction, cloned into pGEM-T Easy Vector, and sequenced. The full length of cloned segment A contains 3259 nucleotides, which includes two partially overlapping open reading fragments (ORFs) ORF1 and ORF2, flanked by 5′ and 3′ noncoding regions. These strains shared high sequence identity with each other either at the nucleotide or deduced amino acid level. Strains HZ2 and JD1 were highly related to two attenuated strains, CEF94 and P2, whereas ZJ2000 was closely related to two other virulent strains, Cu-1 and Harbin. Substitutions of four amino acids at positions 253, 279, 284, and 330, a common feature of attenuated and most virulent strains, were also observed in these three strains. Two major hydrophilic peaks were conserved in the three strains; however, there are two amino acid substitutions at positions 280 (N to S) and 290 (M to L) in the second minor hydrophilic peak for all three strains, which might have a critical influence on antigenicity. Two amino acid substitutions near the VP2-VP4 cleavage site were identified in virulent strain JZ2000, which might be involved in increasing the virulence of the virus. Phylogenetic analyses indicated that these three Chinese strains are most closely related to some European virulent strains but are distinct from very virulent infectious bursal disease virus and variant strains. /// Se amplificó el ADN complementario del segmento A completo de tres cepas del virus de la enfermedad infecciosa de la bolsa. Dos cepas eran atenuadas, llamadas HZ2 y JD1, y una cepa virulenta de campo llamada ZJ2000. El ADN complementario se obtuvo mediante la técnica de transcripción reversa y reacción en cadena de la polimerasa (de la siglas en inglés RT-PCR) y se clonó en el vector pGEM-T Easy, para determinar las secuencias de nucleótidos y de aminoácidos de las tres cepas. El clon del segmento A contenía 3259 nucleótidos, que incluyen dos marcos de lectura continuos parcialmente sobrepuestos, con dos regiones no codificadoras que se encontraron cada una en los extremos 5′ y 3′. Las secuencias de nucleótidos y aminoácidos de estas cepas fueron muy similares entre ellas. La cepas HZ2 y JD1 estuvieron muy relacionadas a las cepas atenuadas CEF94 y P2, mientras que la cepa ZJ2000 estaba relacionada de manera cercana con otras dos cepas virulentas Cu-1 y Harbin. Las sustituciones de cuatro residuos de aminoácidos 253, 279, 284, y 330 que son características de las cepas atenuadas y de las muy virulentas, se observaron también en éstas tres cepas. Los dos picos hidrofílicos estaban conservados en los tres virus, sin embargo, dos sustituciones de aminoácidos ocurrieron en el segundo pico hidrofílico menor en los residuos de aminoácidos 280 (asparagina a serina) y 290 (metionina a lisina) de las tres cepas. Estas sustituciones pueden tener un efecto crítico en la antigenicidad. Dos sustituciones cerca del sitio de separación entre VP2 y VP4 se identificaron en la cepa JZ2000, la cual puede estar relacionada con un incremento en la virulencia del virus. Los análisis filogenéticos indicaron que estas tres cepas Chinas están relacionadas de manera cercana con algunas cepas Europeas pero son distintas a las cepas altamente virulentas del virus de Gumboro.
URL:http://www.jstor.org/stable/1592866
Short Title:Avian Diseases
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