AVIS-IBIS

Birds of Indian Subcontinent

A Genotyping Assay to Determine Plumage Morph in the White-Thorated Sparrow (Zonotrichia albicollis) (Un test génotypique pour déterminer la forme du plumage chez Zonotrichia albicollis)

Publication Type:Journal Article
Year of Publication:2007
Authors:Michopoulos, V, Maney, DL, Morehouse, CB, Thomas, JW
Journal:The Auk
Volume:124
Issue:4
Date Published:2007
ISBN Number:00048038
Keywords:Corvidae, Corvus, Corvus corone, Emberizidae, Zonotrichia, Zonotrichia albicollis
Abstract:In alternate plumage, the White-throated Sparrow (Zonotrichia albicollis) is polymorphic, such that individuals exhibit a median crown stripe that is either white or tan in color. This plumage polymorphism is believed to be caused by a chromosomal inversion and predicts many aspects of an individual's aggressive and parental behavior, which makes this species an interesting and valuable subject for the study of the genetic basis of social behavior. Although the plumage polymorphism is well described, in practice the determination of morph for individual birds is not perfectly straightforward. Whereas morph can be assessed relatively easily in alternate plumage, birds in basic plumage tend to show coloration characteristic of both morphs. During the winter and fall, therefore, plumage morph cannot be determined with 100% accuracy by visual inspection alone. Here, we describe a genotyping assay that reliably predicts morph in alternate plumage. DNA from one drop of blood is amplified by PCR, digested and run on an agarose gel. The resulting banding patterns are used to distinguish white-striped from tan-striped birds with 100% accuracy. This method is fast and economical compared with karyotyping, is far less subjective than assessment of morph by plumage characteristics, and can be performed using any kind of sample from which DNA can be extracted. /// En plumage alternatif, Zonotrichia albicollis est polymorphe, de sorte que les individus présentent une rayure médiane de la calotte qui est blanche ou d'un brun clair. Ce polymorphisme du plumage serait causé par une inversion chromosomique et prédit plusieurs aspects du comportement agressif et parental d'un individu, ce qui fait de cette espèce un sujet intéressant et très utile pour l'étude des bases génétiques du comportement social. Même si le polymorphisme du plumage est bien décrit, la détermination de la forme des oiseaux n'est pas si simple en pratique. Alors que les formes peuvent être établies relativement aisément en plumage alternatif, les oiseaux en plumage de base tendent à exhiber une coloration caractéristique des deux formes. Ainsi, en hiver et en automne, la forme du plumage ne peut être déterminée avec 100% d'exactitude en utilisant seulement l'inspection visuelle. Nous décrivons un test génotypique qui prédit avec fiabilité la forme en plumage alternatif. L'ADN obtenu à partir d'une goutte de sang est amplifié par PCR, digéré et séparé par une électrophorèse sur gel d'agarose. Les patrons des bandes résultantes sont utilisés pour distinguer avec 100% d'exactitude les oiseaux portant une rayure blanche de ceux portant une rayure brune. Cette méthode est rapide et économique en comparaison du caryotypage, elle est beaucoup moins subjective que la détermination de la forme à partir des caractéristiques du plumage et peut être exécutée en utilisant n'importe quel échantillon duquel l'ADN peut être extrait.
URL:http://www.jstor.org/stable/25150392
Short Title:The Auk
Scratchpads developed and conceived by (alphabetical): Ed Baker, Katherine Bouton Alice Heaton Dimitris Koureas, Laurence Livermore, Dave Roberts, Simon Rycroft, Ben Scott, Vince Smith